El Máster se estructura en dos itinerarios: Diversidad Animal y Diversidad Vegetal: 1. El Itinerario de Diversidad Animal introduce al estudiante en el conocimiento de la Zoología, con mucha más profundidad de la que obtiene en la formación de grado preliminar. No sólo adquiere los fundamentos de los tres grandes conjuntos de troncos animales (Artrópodos, Invertebrados No Artrópodos y Vertebrados), sino que se le da la opción de adquirir una cierta especialidad en campos zoológicos aplicados, como la Entomología Aplicada, la Zooarqueología, la Biología Marina o las asignaturas referidas a la gestión. 2. El Itinerario de Diversidad Vegetal introduce al estudiante en el conocimiento de la Botánica, con mucha más profundidad de la que obtiene en la formación de grado preliminar; así debe cursar 6 ECTS de Diversidad y evolución de espermatófitos (en los planes de estudio clásicos, Fanerogamia), y otros 6 ETCS de Diversidad de vegetales sin semilla (Criptogamia). Entre los créditos de carácter optativo, los estudiantes podrán incluir hasta 12 ECTS en materias, asignaturas o actividades formativas diversas de fuera del Máster de Biodiversidad, siempre bajo la supervisión del tutor y previa autorización de la Comisión de Máster.